דלג לתוכן

כימיה של החיים

ביולוגיה AP · נושא 1

שיעור וידאו לנושא זה פתח את עמוד הוידאו
9:24

כימיה של החיים

שלבו קוביית קרח לכוס והיא תצוף. זה נראה רגיל, אך זה מוזר. כמעט כל מוצק אחר טועם בנוזל שלו, כי הקפאה אורגז…

קריאת קול באנגלית · תרגום אנגלי + סינית שרוף בתוך הסרטון

1.1

מבנה המים וקשרי מימן

סיילבוס

רעיון מרכזי 4 — אינטראקציות מערכות: מערכות ביולוגיות נמצאות באינטראקציה זו עם הזו, ומערכות אלו ואינטראקציותיהן מציגות תכונות מורכבות.

מטרות למידה 1.1.A: הסבר כיצד התכונות של המים הנובעות מקוטביות ובקשרי מימן משפיעות על הפונקציה הביולוגית שלו.

  • 1.1.A.1 מערכות חיות תלויות בתכונות המים כדי לתמוך בחיים.
    • 1.1.A.1.i למים יש קוטביות, בשל יצירת קשרים קוולנטיים קוטביים בין מימן לחמצן בתוך מולקולות מים. קוטביות זו תורמת לקשרי מימן בין ולתוך מולקולות ביולוגיות.
    • 1.1.A.1.ii למים יש קיבולת חום ספציפית גבוהה, מה שמאפשר שמירה על טמפרטורת הגוף הבית-חומתית בתוך בעלי חיים.
    • 1.1.A.1.iii למים יש חום אידוי גבוה, מה שמאפשר קירור באמצעות אידוי לסביבה הסובבת. בבעלי חיים, תכונה זו מאפשרת שמירה על טמפרטורת הגוף.
  • 1.1.A.2 קשרי המימן בין מולקולות מים קוטביות סמוכות מובילים להדבקה פנימית, הדבקה חיצונית ולמתיחה פני שטח.

מקור: תיאור הקורס והמבחן של College Board AP

קרח צף על המים כי קשרי מימן הופכים את המים המוצקים לצפופים יותר מהמים הנוזלים
קרח צף על המים כי קשרי מימן הופכים את המים המוצקים לצפופים יותר מהמים הנוזלים

המים הם קוטביים: החמצן חושף אלקטרונים חזק יותר מההידרוגן שלו, מה שנותן לחמצן מטען שלילי מעט ולהידרוגן מטען חיובי מעט. דבר זה מאפשר למולקולות מים ליצור קשרי מימן זו עם זו, מה שמסביר את התכונות התומכות בחיים של המים:

  • הדבקה פנימית והדבקה חיצונית (מתח פני, פעילות קפילרית, עליית מים בצמחים),
  • חום ספציפי גבוה (עמיד בפני שינויי טמפרטורה, יציבות אורגניזמים),
  • חום אידוי גבוה (קירור באידוי),
  • קרח צף (מוצק צפוף יותר), והיותו ממיס מצוין לחומרים קוטביים ויוניים.
קשר מימן בין שתי מולקולות מים קוטביים
קשר מימן בין שתי מולקולות מים קוטביים
חקור

חקור כיצד קשר קוולנטי משתף אלקטרונים

עבור שלב-אחר-שלב על שני אטומים השואפים זה את זה כדי להשתף בזוג אלקטרונים כך שכל אחד יגיע למעטפת מלאה. ב$\text{H}_2$ שני האטומים מושכים באותה עוצמה, ולכן הקשר הוא לא-קוטבי — ההבדל הזה הופך את ההתחלפות הבלתי-שוויונית במים (וגם את ה$\delta^+/\delta^-$ הקוטביות שלהם) למשהו חשוב מאוד.

מילון מונחים אימון
English עברית
polar/ˈpəʊlə/ קוטבי
hydrogen bonds/ˈhaɪdrədʒn bɒndz/ קשרי מימן
Cohesion/kəʊˈhiːʒn/ כוחות קוהזיה
adhesion/ədˈhiːʒn/ הידבקות
specific heat/spəˈsɪfɪk hiːt/ חום ספציפי
Carbon/ˈkɑːbən/ פחמן
macromolecules/ˈmækrəmɒlɪkjuːlz/ מולקולות ענק
polymers/ˈpɒlɪməz/ פולימרים
monomers/ˈmɒnəʊməz/ מונומרים
dehydration synthesis/ˌdiːhaɪˈdreɪʃn ˈsɪnθəsɪs/ סינתוז על ידי דהידרוגנציה
hydrolysis/haɪˈdrɒləsɪs/ הידרוליזה
Carbohydrates/ˌkɑːbəʊˈhaɪdreɪts/ פחמימות
monosaccharides/ˈmɒnəʊsækɑːraɪdz/ מונוסכרידים
cellulose/ˈseljuːləʊs/ צלולוזין
Lipids/ˈlɪpɪdz/ ליפידים
hydrophobic/ˌhaɪdrəˈfəʊbɪk/ הידרופובי
phospholipids/ˈfɒsfəlɪpɪdz/ פוספוליפידים
Nucleic acids/njuːˈklɪɪk ˈæsɪdz/ חומצות גנטיות
nucleotides/ˈnjuːklɪɒtaɪdz/ ניאוטינודים
Proteins/ˈprəʊtiːnz/ חלבונים
amino acids/əˈmiːnəʊ ˈæsɪdz/ חומצות אמינו
peptide bonds/ˈpeptaɪd bɒndz/ קשרי פפטיד
denature/ˈdenətʃə/ דנורציה
1.2

יסודות החיים

סיילבוס

רעיון מרכזי 2 — אנרגטיקה: מערכות ביולוגיות משתמשות באנרגיה ובבלוקי בנייה מולקולריים לצמיחה, רבייה ותחזוקה של בית-חום דינמי.

מטרות למידה 1.2.A: תיאור הרכב המקרומולקולות הנדרשות על ידי בעלי חיים.

  • 1.2.A.1 אטומים ומולקולות מהסביבה נדרשים לבניית מולקולות חדשות. פחמן, מימן וחמצן הם האלמנטים הנפוצים ביותר המשמשים לבניית מולקולות ביולוגיות כמו פחמימות, חלבונים, ליפידים וחומצה גרעינית. בנוסף:
    • 1.2.A.1.i גופרית משמש בבניית חלבונים.
    • 1.2.A.1.ii פוספורוס משמש בבניית פוספוליפידים (סוג של ליפיד) וחומצה גרעינית.
    • 1.2.A.1.iii חנקן משמש בבניית חומצה גרעינית.

מקור: תיאור הקורס והמבחן של College Board AP

חומר חי בנוי בעיקר מספר יסודות – פחמן, הידרוגן, חמצן, חנקן, זרחן וסולפיד. פחמן הוא מרכזי מכיוון שהוא יוצר ארבעה קשרים קוולנטיים יציבים, ובונה שרשראות ארוכות, ענפים וטבעות – השלדים של כל המולקולות הביולוגיות.

פחמימות ושומנים מכילים פחמן, הידרוגן וחמצן; חלבונים גם מכילים חנקן
פחמימות ושומנים מכילים פחמן, הידרוגן וחמצן; חלבונים גם מכילים חנקן
1.3

מבוא למולקולות גדולות

סיילבוס

רעיון מרכזי 4 — אינטראקציות מערכות: מערכות ביולוגיות נמצאות באינטראקציה זו עם הזו, ומערכות אלו ואינטראקציותיהן מציגות תכונות מורכבות.

מטרות למידה 1.3.A: תיאור התגובות הכימיות בונות ומפרקות מקרומולקולות ביולוגיות.

  • 1.3.A.1 הידרוליזה היא תגובה כימית המעוררת שבירת קשרים קוולנטיים. סוג זה של תגובה מפרק מולקולות למולקולות קטנות יותר. כאשר מוסיפים מים לקשר בין מונומרים בפולימר, הקשר נשבר. יון ההידרוגן ממולקולת המים מתווסף למונומר אחד והקבוצת ההידרוקסיל ממולקולת המים מתווספת למונומר השני, ומשלמים את התגובה.
  • 1.3.A.2 סינתזת דהידרציה מתרחשת כאשר שתי מולקולות קטנות מחוברות יחד באמצעות קישור קוולנטי. יון מימן מוסר ממונומר אחד וקבוצת הידרוקסיל מוסרת ממונומר השני. דבר זה גורם לאובדן הערך השווה למולקולת מים מהתגובה והחיבור בין שני המונומרים שנותרו. חיבור של מספר רב של מונומרים נקרא פולימריזציה.

מקור: תיאור הקורס והמבחן של College Board AP

מולקולות ביולוגיות גדולות – מולקולות ענק – הן פולימרים הבנויים ממונומרים חוזרים. תאים מחברים מונומרים באמצעות סינתזת אבדן מים (הסרת מים ליצירת קשר) ומפרקים פולימרים באמצעות הידרולזה (וספת מים). ארבעה סוגים: פחמימות, ליפידים, חומצה גנטית וחלבונים.

סינתזת דהידרציה בונה פולימרים ומשחררת מים; הידרולוזה הופכת תהליך זה
סינתזת דהידרציה בונה פולימרים ומשחררת מים; הידרולוזה הופכת תהליך זה
חקור

חקור את ארבעת סוגי המכרמולים הגדולים לפי המונומר שלהם

סדר כל רמז בקטגוריית המכרמול הגורמת לו הנכונה על ידי התאמת המונומר הבונה אותו – פרוקות, נוקלאוטידים או חומצות אמינו – ושים לב שמ脂ידים הם המקרה החריג שאינו פולימרים אמיתיים.

1.4

פחמימות

סיילבוס

רעיון מרכזי 4 — אינטראקציות מערכות: מערכות ביולוגיות נמצאות באינטראקציה זו עם הזו, ומערכות אלו ואינטראקציותיהן מציגות תכונות מורכבות.

מטרות למידה 1.4.A: לתאר את המבנה והפונקציה של פחמימות.

  • 1.4.A.1 מונוסכרידים (סוכרים פשוטים) הם המונומרים לפוליסכרידים (פחמימות מורכבות). מונומרים אלו מחוברים על ידי קשרים קוולנטיים כדי ליצור פולימרים כמו פחמימות מורכבות, שיכולים להיות ליניאריים או ערוכים.
    • דוגמאות להמחשה ל-1.4.A.1:
      • תאית
      • עמילן
      • גליקוגן
    • הערה לגבי היעדר חומר: מבנה מולקולרי ספציפי של פולימרים פחמימתיים אינו נכלל בתוכנית הלימודים לבחינת AP.

מקור: תיאור הקורס והמבחן של College Board AP

פחמימות עשויות ממונומרים של סוכר (מונוסכרידים כמו גלוקוז). הן מאחסנות אנרגיה (עמילן, גליקוגן) ומספקות מבנה (צלולוז בקירות התא בצמחים). קבוצות ההידרוקסיל הרבות שלהן הופכות אותן לקוטביות ויכולות להתמס במים.

צורות הפוליסכרידים לאחסון (עמילן, גליקוגן) והצלולוז המבני
צורות הפוליסכרידים לאחסון (עמילן, גליקוגן) והצלולוז המבני
1.5

ליפידים

סיילבוס

רעיון מרכזי 4 — אינטראקציות מערכות: מערכות ביולוגיות נמצאות באינטראקציה זו עם הזו, ומערכות אלו ואינטראקציותיהן מציגות תכונות מורכבות.

מטרות למידה 1.5.A: לתאר את המבנה והפונקציה של שומנים (ליפידים).

  • 1.5.A.1 שומנים (ליפידים) הם בדרך כלל מולקולות לא-קוטביות והידרופוביות, ומבנהן ופונקציותיהם נגזרות מהדרך שבה רכיבי המשנה שלהם מאורגנים. חומצות שומן יכולות להתואר כשבוניות או כבלתי-שוניות.
    • 1.5.A.1.i חומצות שומן שבוניות מכילות רק קשרים יחידים בין אטומי פחמן.
    • 1.5.A.1.ii חומצות שומן בלתי-שוניות מכילות לפחות קשר כפול אחד בין אטומי פחמן, מה שגורם לשרשרת הפחמן להתכופף.
    • 1.5.A.1.iii ככל שהכמות של קשרים כפולים בזנב החומצה השומנית גדולה יותר, כך הליפיד נהיה בלתי-שוני יותר.
    • 1.5.A.1.iv ככל שהליפיד בלתי-שוני יותר, כך הוא נוטה להיות נוזלי יותר בטמפרטורת החדר.
  • 1.5.A.2 שומנים מספקים מגוון פונקציות לאורגניזמים חיים. דוגמאות לשומנים הן שומנים, סטרואידים כגון כולסטרול, ופוספוליפידים.
    • 1.5.A.2.i שומנים מספקים אחסון אנרגיה ותומכים בפונקציית התא. במקרים מסוימים, הם יכולים גם לספק בידוד תרמי שעוזר לשמור על חום בגוף היונקים.
    • 1.5.A.2.ii סטרואידים הם הורמונים התומכים בפונקציות פיזיולוגיות כגון גידול ופיתוח, מטבוליזם אנרגטי ושימור homeostasis.
    • 1.5.A.2.iii כולסטרול מספק יציבות מבנית הכרחית לקרום תאי בעלי חיים.
    • 1.5.A.2.iv פוספוליפידים מתאגדים זה עם זה כדי ליצור את שכבת הדו-שומנית הנמצאת בקרום התא ובקרום הרקמה.
    • הודעת איסור: המבנה המולקולרי של ליפידים ספציפיים אינו נכלל במסגרת המבחן האפליקטיבי.

מקור: תיאור הקורס והמבחן של College Board AP

ליפידים הם לא-קוטביים ואינם מתערבלים עם מים (הידרופוביים). הם כוללים שומנים (אחסון אנרגיה לטווח ארוך), פוספוליפידים (שהם בונים ממברנות), וסטרואידים. לפוספוליפיד יש "ראש" קוטבי ו-"זנבים" לא-קוטביים, הדבר הקריטי לממברנת התא.

לפוספוליפיד יש ראש קוטבי ושני זנבים לא-קוטביים, ולכן פוספוליפידים יוצרים שכבה כפולה
לפוספוליפיד יש ראש קוטבי ושני זנבים לא-קוטביים, ולכן פוספוליפידים יוצרים שכבה כפולה
טריגליצריד: גליצרול מחובר לשלושה חומצות שומן
טריגליצריד: גליצרול מחובר לשלושה חומצות שומן
1.6

חומצות גרעין

סיילבוס

רעיון מרכזי 3 — אחסון ומעבר מידע: מערכות חיות מאחסנות, מוצאות, משדרות ומגיבות למידע הקריטי לתהליכי החיים.

מטרות למידה 1.6.A: לתאר את המבנה והפונקציה של DNA ו-RNA.

  • 1.6.A.1 בחומצות גרעין (DNA ו-RNA), המידע הביולוגי מופקד ברצפים של מונומרים נאוטאטידיים. לכל נאוטאטיד ישנם רכיבי המבנה הבאים: סוכר בעל חמישה פחמן (דאוקסיריבוז או ריבוז), קבוצת פוספט, ובסיס א滋וטני (אדנין, תימין, גואנין, ציטוזין או יורציל).
  • 1.6.A.2 לחומצות גרעין יש רצף ליניארי של נאוטאטידים עם קצוות, המוגדר על ידי קבוצת ההידרוקסיל ב-3' (שלוש פרیم) ובפוספטים ב-5' (חמש פרیم) של הסוכר בנאוטאטיד. במהלך סינתזה של חומצות גרעין, נאוטאטידים נוספים לקצה ה-3' של הרצועה הגדלה, מה שגורם ליצירת קשרים קוולנטיים בין נאוטאטידים.
    • הצהרת פסילה: המבנה המולקולרי של נאוטאטידים ספציפיים אינו נכלל בתוכן בדיחתי ה-AP Exam.
  • 1.6.A.3 ל-DNA מבנה של הלכס דו-סלילי אנטי-פראלל, עם שני רצועות נאוטאטידים הפועלות בכיוונים מנוגדים באוריינטציה מ-5' ל-3'. ב-DNA, נאוטאטידים של אדנין זוגי עם נאוטאטידים של תימין באמצעות קשרי מימן (A-T), ונאוטאטידים של ציטוזין זוגי עם נאוטאטידים של גואנין באמצעות קשרי מימן (C-G). ב-RNA, אדנין זוגי עם יורציל (A-U).
  • 1.6.A.4 הבדלים מבניים בין DNA ל-RNA כוללים:
    • 1.6.A.4.i ל-DNA יש הסוכר דאוקסיריבוז, ול-RNA יש הסוכר ריבוז.
    • 1.6.A.4.ii ל-DNA יש הבסיס האזוטני תימין, ול-RNA יש הבסיס האזוטני יורציל.
    • 1.6.A.4.iii ל-DNA יש בדרך כלל שני רצועות, בעוד ש-RNA הוא בדרך כלל חד-רצועי.

מקור: תיאור הקורס והמבחן של College Board AP

מודל מלא החלל של ה-DNA כפול הסליל (NHGRI)
מודל מילוי מרחב של הספירלה הכפולה של DNA (NHGRI)

חומצות גרעין (DNA ו-RNA) מאחסנות ונושאות מידע גנטי. המונומרים שלהן הם נקאוטידים, כל אחד מהם מכיל סוכר, פוספט ובסיס חנקני. רצף הבסיסים מקודד הוראות; DNA הוא דו-שרטוני, RNA חד-שרטוני.

זיווג בסיסים משלים מחזיק את שני המוטות האנטי-מקבילים של ה-DNA יחד
התאמת בסיסים משלימה מחזיקה את שני השרטונים האנטי-פראללים של DNA יחד
חקור

חקור זיווג בסיסים משלים

התקדם לאורך תבנית DNA וצפה כל בסיס נזוג לשותפו באמצעות זיווג בסיסים משלים ($A$ עם $T$, $G$ עם $C$) — הכלל המאפשר לכל רצועה לשמש כתבנית לבניית הרצועה השנייה.

1.7

חלבונים

סיילבוס

רעיון מרכזי 3 — אחסון ומעבר מידע: מערכות חיות מאחסנות, מוצאות, משדרות ומגיבות למידע הקריטי לתהליכי החיים.

מטרות למידה 1.7.A: לתאר את המבנה והפונקציה של חלבונים.

  • 1.7.A.1 חלבונים מורכבים מרצועות ליניאריות של חומצות אמינו המחוברות באמצעות יצירת קשרים קוולנטיים (פפטידיים) הנוצרים בין קבוצת קרבוקסיל ($-\text{COOH}$) של חומצת אמינו אחת לבין קבוצת אמינו ($-\text{NH}_2$) של חומצת האמינו הבאה, מה שגורם ליצירת רצועת פפטיד גדלה.
  • 1.7.A.2 חומצות אמינו מורכבות מאטום פחמן מרכזי עם אטום מימן, קבוצת קרבוקסיל, קבוצת אמינו, וקבוצת R משתנה הקשורה לו בקשר קוולנטי. קבוצת ה-R של חומצת אמינו יכולה להיות מסווגת לפי שלושה סוגי תכונות כימיות אפשריות: הידרופובית/לא מקוטבת, הידרופילית/מקוטבת, או יונית. האינטראקציות של קבוצות ה-R אלו קובעות את המבנה והפונקציה של האזור ההוא בחלבון.
  • 1.7.A.3 הרצף הספציפי של חומצות האמינו בחלבונים קובע את המבנה הראשוני של הפוליפפטיד כמו גם את הצורה הכללית של החלבון.
    • הצהרת פסילה: המבנה המולקולרי של חומצות אמינו אינו נכלל בתוכן בדיחתי ה-AP Exam.
  • 1.7.A.4 מבנים משניים של חלבונים נוצרים דרך קיפול מקומי הנוצר מתוך אינטראקציות בין אטומים של הגבול הפוליפפטידי של רצועת חומצות האמינו. קשרי מימן יוצרים צורות כמו אלפא-הלכסים ודפים מקופלים בטא.
  • 1.7.A.5 הצורה התלת-ממדית של המבן השלישוני של חלבון נובעת מהיווצרות של קשרי מימן, אינטראקציות הידרופוביות, אינטראקציות יוניות, או גשרי דיסולפידי.
  • 1.7.A.6 המבנה הרביעי נובע מאינטראקציות בין מספר פוליפפטידים. ארבעת רמות המבנה של חלבון קובעות את תפקודו.

מקור: תיאור הקורס והמבחן של College Board AP

מבנה רביעוני של הימוגלובין: ארבעה מוטות פוליפפטיד מתקפלים, כל אחד מחזיק בקבוצת הים
מבנה רביעי של המוגלובין: ארבע שרשראות פוליפפטיד מתקפלות, כל אחת נושאת קבוצת המ

חלבונים הם פולימרים של חומצות אמינו הקשורים על ידי קשרי פפטיד. הרצף שלהם מתקפל לצורת 3-D ספציפית בארבעה רמות (ראשונית, משניית, טירטירית, אקווריונית), ו-הצורה קובעת את הפונקציה – כאנזימים, משאבים, מקבלים וחלקים מבניים. שינוי בסביבה (חום, pH) יכול להכשיר חלבון, לפתוח אותו ולהפסיק את פעולתו.

חומצה אמינונית, וקשר הפיפטידי שנוצר על ידי התכווצות
חומצה אמינו, והקשר הפפטי הנוצר על ידי קונדנסציה
ארבעת רמות המבנה של חלבונים
ארבע רמות המבנה של חלבונים

דוגמא פותרת. בניית פולימר מ-10 מונומרים באמצעות סינתזת הידרציה יוצרת 9 קשרים ושחרור 9 מולקולות מים — אחת לכל קשר, ולכן $N$ מונומרים משחררים $N-1$ מים. הידרוליזה הופכת תהליך זה בדיוק: הוספת 9 מולקולות המים הללו מפרקת את הפולימר חזרה ל-10 מונומרים. זוהי הסיבה שביוסנתזה (הידרציה) והעכלה (הידרוליזה) הן נגוד כימיים.

1.7

טיפים לבחינות

  • עקוב אחר כל תכונה של מים אל מקורה ב-קוטביות ובקשרי מימן (הדבקה, חום ספציפי גבוה, כוח ממס).
  • הכיר את ארבעת הקטגוריות של המקרומולקולות ואת המונומרים שלהן; פולيمרים נבנים על ידי סינתוז הידרציה ומפורקים על ידי הידרוליזה.
  • בחלבונים, מבנה (צורה) קובע פונקציה — חום או שינוי ב-pH משנים את המבנה שלהם ומפסיקים את פעילותם.
  • ב-DNA הבסיסים זוגיים A–T ו-C-G על מסלולים אנטי-פראלללים; RNA הוא חד-שרידי ומשתמש ב-U.
  • קשר כל מולקולה לתפקידה (פחמימות: אנרגיה/מבנה; ליפידים: ממברנות/אחסון; חומצות גנטיות: מידע).

שיעורים אינטראקטיביים בנושא זה

לעבור על הדברים צעד אחר צעד, עם תרגילים לבדיקה מיידית.

מבחני עבר

נושאים נוספים בביולוגיה AP

היכנס או צור חשבון

IGCSE, A-Level & AP