分類、生物多様性と保全

種は複数の方法で定義できます：

• 生物学的種概念 — 相互に交配して生育可能な子孫を残す集団。
• 形態学的種概念 — 外見が似ている集団。
• 生態学的種概念 — 環境内で同じ役割を果たす集団。

3つのドメイン

分類における最大のグループは3つのドメインです：

• 古細菌（Archaea） と 細菌（Bacteria） — どちらも原核生物（核を持たない）です。見た目は似ていますが、膜脂質、リボソームRNA、および細胞壁の構成が異なります。
• 真核生物（Eukarya） — 細胞に核を持つすべての生物。

分類階層

真核生物ドメイン内では、生物は分類階層に分類されます。これは小さくなっていくグループのセットであり、界、門、綱、目、科、属、種から成ります。

真核生物は4つの界に分けられます：

• 原生生物界（Protoctista） — 主に単細胞（アミバなど）。
• 菌界（Fungi） — 栄養を吸収して摂取し、キチン性の細胞壁を持つ。
• 植物界（Plantae） — 光合成によって自ら食物を作る。
• 動物界（Animalia） — 他の生物を摂食する。

ウイルスはこのグループには含められません。核酸の種類（DNAまたはRNA）、そしてそれが一本鎖か二本鎖かによって分類されます。

生態系とは、ある地域内のすべての生物とその非生物的周囲を合わせたものです。ニッチとは、その中での特定の種の役割や位置づけを指します。

サンゴ礁は高い生物多様性を表す良い例です — 多くの異なるサンゴ、魚類、その他の種が一緒に住んでいます：

生物多様性は3つのレベルで測定できます：

• 異なる生態系および生息地の数と範囲。
• 種の数とそれらの相対的な豊度（それぞれの種がどれほど一般的か）。
• 各種内の遺伝的多様性。

区域のサンプリング

すべての生物を数えることはできませんので、サンプルを取ります。無作為サンプリング（偶然によって位置を選ぶこと）はバイアスを避け、公平な結果を与えます。有用な方法として以下があります：

• クワドラット — 内部の種を数えたり推定したりするために置く正方形の枠。
• トランセクト — 区域内を横切る線に沿って数える（ライン・トランセクトは線に触れたものを記録し、ベルト・トランセクトはストリップ内を数える）。
• マーク・リリース・リキャプチャ法 — 移動する動物用：いくつか捕まえてマークをつけ、解放してから、後に新しい捕獲物の中でマークがついているものが何割かを調べる（リンカン指数）。

ある種の分布を生物的要因（生物由来）または非生物的要因（非生物由来）に結びつけるには、 Spearmanの順位相関またはPearsonの相関係数を用いることができる。ある地域の多様性を単一の数値で表すには** Simpson多様性指数**を使用する。値が高いほど多様性が高く、通常は安定性も高いことを示す。

** worked example.** 60匹のカタツムリを捕まえ、マークをつけ、放出しました。その後、80匹のカタツムリを捕まえたところ、そのうち15匹にマークがついていました。個体数を推定してください。リンカン指数は、マークをつけた動物が均等に混合していると仮定するため、第2のサンプル中のマークつきの割合は、全体 population 中のマークつきの割合に等しいとみなします：

したがって、約320匹のカタツムリがいると推定されます。この推定値は前提条件に依存するため、その前提を明記する必要があります：2回の捕獲の間で出生、死亡、または移動がないこと；印が擦り落ちたり、捕食者に発見されやすくなったりしないこと；そして混合に十分な時間が与えられていることです。1匹でも破損すれば、推定も崩れます。捕食者を惹きつける印は再捕獲数を減らすため、個体数を過大評価することになります。

気候変動、競合（特に新種によるもの）、人間による猟、あるいは生息地の破壊・喪失によって、ある種は絶滅（完全に姿を消す）することがあります。

私たちは生物多様性を保護しようとするのは、他の種が私たちに食物、医薬品、材料を提供し、生態系の安定性を維持する手助けをし、またそれ自体にも価値があるからです。

種の保全方法

• 動物園や植物園は絶滅危惧種を飼育・繁殖させる。
• 国立公園や海洋公園などの保護された保全区域は、生息地を守ります。
• 「フローズン・ズー」は凍結細胞、卵、精子を保存し、種子バンクは将来のために種子を保管します。

希少哺乳類に対しては、補助生殖によって個体数を増やすことができます：体外受精（IVF）、胚移植、そして代理妊娠（別のメスが幼体を妊娠する）。

保全関係者はまた、他地域から持ち込まれ、在来種よりも強く競合する外来種の管理も行います。

世界中で活動する2つの組織があり、IUCNは各種の絶滅危惧度をリストアップし、CITESは絶滅危惧動植物の国際取引を管理しています。

• 分類階層（ドメイン → 界 → … → 種）と3つのドメインを理解し、互いに交配して可fertileな子孫を生むのが一種であることを確認します。
• ** Simpson指数**を用いて生物多様性を測定し（数値が高いほど多様性が高い）、なぜ高い生物多様性が安定性に寄与するかを説明します。
• 在場保全と離場保全の方法を挙げ、それぞれの利点を述べてください。