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A-Level 生物 · 第 3 主题

训练
讲义 词汇表
3.1

酶的作用机制

大纲
  1. state that enzymes are globular proteins that catalyse reactions inside cells (intracellular enzymes) or are secreted to catalyse reactions outside cells (extracellular enzymes)
  2. explain the mode of action of enzymes in terms of an active site, enzyme–substrate complex, lowering of activation energy and enzyme specificity, including the lock-and-key hypothesis and the induced-fit hypothesis
  3. investigate the progress of enzyme-catalysed reactions by measuring rates of formation of products using catalase and rates of disappearance of substrate using amylase
  4. outline the use of a colorimeter for measuring the progress of enzyme-catalysed reactions that involve colour changes

来源:剑桥国际大纲

酶的作用:锁与钥匙

(enzymes)是球状蛋白质(globular proteins)——一种带圆形、可溶形状的蛋白质(protein)。它们是生物催化剂:它们催化(catalyse,加速)生物中的化学反应,而且它们不被消耗,所以每个酶一遍又一遍地工作。

酶在两个地方工作:

  • 细胞内(intracellular)的酶在制造它们的细胞(cell)内部工作。一个例子是过氧化氢酶(catalase),它分解有害的过氧化氢。
  • 细胞外(extracellular)的酶被分泌(secreted,送出)以在细胞外工作。一个例子是淀粉酶(amylase),它被释放到肠道以消化(digest)淀粉(starch)。
气泡在一个发酵酵母的容器中上升
酵母的酶发酵糖,放出二氧化碳的气泡
词汇表 训练
英文 中文 拼音
enzyme méi
globular protein 球状蛋白质 qiú zhuàng dàn bái zhì
protein 蛋白质 dàn bái zhì
catalyse 催化 cuī huà
intracellular 细胞内 xì bāo nèi
cell 细胞 xì bāo
catalase 过氧化氢酶 guò yǎng huà qīng méi
extracellular 细胞外 xì bāo wài
secrete 分泌 fēn mì
amylase 淀粉酶 diàn fěn méi
digest 消化 xiāo huà
starch 淀粉 diàn fěn
3.1

酶如何起作用

每个酶有一个叫活性位点(active site)的特殊口袋。它作用的分子是它的底物(substrate)。底物嵌入活性位点以构成一个酶底物复合物(enzyme–substrate complex)。然后反应发生,而产物(products)离开,腾出活性位点给下一个底物。

Specificity

一个酶是专一的:它通常只作用于一个底物。这是因为活性位点的形状与那个底物而非其他的形状是互补(complementary,契合)的。我们把这叫专一性(specificity)。

两个思想解释底物如何契合:

  • 锁钥学说(lock-and-key hypothesis)——活性位点是一个固定的形状,只有一个带匹配形状的底物才契合,像一把钥匙在一把锁里。
  • 诱导契合学说(induced-fit hypothesis)——活性位点起初不完全是正确的形状。当底物结合时,活性位点稍微改变形状以紧紧地包住它。这个思想更好地符合证据。
两个图:在锁钥中一个三角形的底物契合一个刚性凹口;在诱导契合中酶围绕一个圆形的底物塑形
锁钥:一个固定的活性位点。诱导契合:活性位点改变形状以抓住底物

Lowering activation energy

每个反应需要一小"推"能量来开始,叫活化能(activation energy)。一个酶降低活化能。这让反应在细胞的正常温度(temperature)下快速进行,而不需要高热。

一个带两个隆起的能量剖面:没有酶时一个高隆起,有酶时一个较低的隆起,两者连接同样的反应物和产物
酶的路线有一个较低的活化能($E_A$),所以更多的分子能反应
探索

The catalytic cycle

Step through the cycle. The enzyme binds its substrate, the reaction happens, the products leave — and the same enzyme is free to go again.

词汇表 训练
英文 中文 拼音
active site 活性位点 huó xìng wèi diǎn
substrate 底物 dǐ wù
enzyme–substrate complex 酶底物复合物 méi dǐ wù fù hé wù
product 产物 chǎn wù
complementary 互补 hù bǔ
specificity 专一性 zhuān yī xìng
lock-and-key hypothesis 锁钥学说 suǒ yuè xué shuō
induced-fit hypothesis 诱导契合学说 yòu dǎo qì hé xué shuō
activation energy 活化能 huó huà néng
3.1

测量反应速率

你可以用两种方式跟踪一个酶反应:

  • 测量产物制造得多快。用过氧化氢酶,氧气是一个产物,所以你收集气体并随时间测量它的体积。
  • 测量底物消失得多快。用淀粉酶,你取出样品并用碘测试;随着淀粉被用尽,蓝黑色褪去。

一个比色计(colorimeter)使这个精确。它让光穿过管子并测量吸收了多少光,所以一个颜色变化变成一个你可以画图的数字。

反应速率(rate of reaction)在开始时最陡(存在最多的底物),所以初速率(在时间零的斜率)是最公平的比较值。

一条产物形成对时间的曲线,在开始时最陡然后趋平;时间零处的一条虚切线标记初速率
产物在开始时积累得最快;初速率是时间零处切线的斜率——最公平的比较值

例题。 在一个过氧化氢酶反应的头 $20$ 秒里,收集了 $16\ \text{cm}^3$ 的氧气。估计反应速率。

$$\text{rate} = \frac{\text{volume of product}}{\text{time}} = \frac{16}{20} = 0.8\ \text{cm}^3\,\text{s}^{-1}.$$

因为反应在开始时最快,在这个短的早期区间上测量给出一个接近初速率的值;在一个更长的时间上取平均会包括较慢的后期阶段并低估它。

词汇表 训练
英文 中文 拼音
colorimeter 比色计 bǐ sè jì
rate of reaction 反应速率 fǎn yìng sù lǜ
3.2

影响酶活性的因素

大纲
  1. investigate and explain the effects of the following factors on the rate of enzyme-catalysed reactions: • temperaturepH (using buffer solutions) • enzyme concentrationsubstrate concentrationinhibitor concentration
  2. explain that the maximum rate of reaction ($V_{\text{max}}$) is used to derive the Michaelis–Menten constant ($K_{\text{m}}$), which is used to compare the affinity of different enzymes for their substrates
  3. explain the effects of reversible inhibitors, both competitive and non-competitive, on enzyme activity
  4. investigate the difference in activity between an enzyme immobilised in alginate and the same enzyme free in solution, and state the advantages of using immobilised enzymes

来源:剑桥国际大纲

Temperature

随着温度上升,分子获得更多的动能(kinetic energy)并更频繁地碰撞(collide),所以速率上升。但在最适温度(optimum temperature)之上,酶开始变性(denature):热打断保持它形状的键,所以活性位点改变并不再契合底物。然后速率快速下降。

一张反应速率对温度的图,上升到最适温度处的一个峰,然后随着酶变性陡峭下降
速率上升到最适温度,然后随着酶变性快速下降

pH

每个酶有一个最适 pH。若 pH 离它移动太远,酶变性而速率下降。要公平地研究 pH,你用一个缓冲液(buffer solution)保持它稳定。

一张钟形的反应速率对 pH 的图,在最适 pH 处达到峰值并在每一侧下降
速率在最适 pH 处达到峰值并在任一侧下降

Enzyme concentration

在有大量底物时,更多的酶意味着更多的活性位点,所以速率与酶浓度成正比地上升。

Substrate concentration

起初,加更多的底物加速反应。但一旦每个活性位点都忙碌,加更多就没有区别了——速率在一个最大值趋平。

Inhibitor concentration

一个抑制剂(inhibitor)是一个减慢一个酶的分子。存在的抑制剂越多,速率越低。

探索

How temperature changes enzyme activity

Drag the temperature slider. Activity rises to an optimum, then crashes as the enzyme denatures and its active site loses shape.

词汇表 训练
英文 中文 拼音
temperature 温度 wēn dù
kinetic energy 动能 dòng néng
collide 碰撞 pèng zhuàng
optimum temperature 最适温度 zuì shì wēn dù
denature 变性 biàn xìng
buffer solution 缓冲液 huǎn chōng yè
inhibitor 抑制剂 yì zhì jì
3.2

最大反应速率与米氏常数

趋平的速率,当所有活性位点都满时,是最大速率,写成 $V_{\text{max}}$

米氏常数(Michaelis–Menten constant,$K_{\text{m}}$)是给出 $V_{\text{max}}$的底物浓度。它告诉你关于酶对它底物的亲和力(affinity,拉力):

  • 一个$K_{\text{m}}$ 意味着酶在一个低底物浓度就达到半速,所以它有一个亲和力。
  • 一个$K_{\text{m}}$ 意味着一个亲和力。

所以 $K_{\text{m}}$ 让你比较不同的酶多强地抓住它们的底物。

一条反应速率对底物浓度的曲线,上升到 Vmax 处的一个平台,Vmax 的一半和对应的 Km 被标记
当所有活性位点都满时速率爬升到 $V_{\text{max}}$;$K_{\text{m}}$ 是给出 $V_{\text{max}}$ 一半的底物浓度
探索

Substrate concentration and Vmax

Add more substrate: the rate climbs, then plateaus at $V_{max}$ once every active site is busy. $K_m$ is the substrate concentration that gives half of $V_{max}$.

词汇表 训练
英文 中文 拼音
Michaelis–Menten constant 米氏常数 mǐ shì cháng shù
affinity 亲和力 qīn hé lì
3.2

可逆抑制剂

一些抑制剂是可逆(reversible)的:它们能再次离开酶。有两种类型。

类型 它在哪里结合 加更多底物的效果 $V_{\text{max}}$$K_{\text{m}}$ 的效果
竞争性抑制剂(competitive inhibitor) 在活性位点(它有一个与底物相似的形状) 更多底物胜过它,所以它的效果被减少 $V_{\text{max}}$ 不变;$K_{\text{m}}$ 上升
非竞争性抑制剂(non-competitive inhibitor) 在另一个位点,改变活性位点的形状 加更多底物没有帮助 $V_{\text{max}}$ 下降;$K_{\text{m}}$ 不变
三条对底物浓度的速率曲线:无抑制剂达到 Vmax;竞争性更慢地达到同样的 Vmax;非竞争性在一个较低的 Vmax 趋平
一个竞争性抑制剂提高 $K_{\text{m}}$(更多底物克服它);一个非竞争性的降低 $V_{\text{max}}$
词汇表 训练
英文 中文 拼音
reversible 可逆 kě nì
competitive inhibitor 竞争性抑制剂 jìng zhēng xìng yì zhì jì
non-competitive inhibitor 非竞争性抑制剂 fēi jìng zhēng xìng yì zhì jì
3.2

固定化酶

一个固定化酶(immobilised enzyme)被固定在原位——例如,被困在海藻酸盐(alginate)的小珠里面——而不是在溶液中自由漂浮。底物溶液流过这些珠。

一个充满酶的珠,底物从一侧流入、产物从另一侧流出,酶保持被困在里面
酶保持被困在珠里,而底物流入、产物流出——所以酶从不被冲走

一个自由的酶通常工作得快一点,因为底物能容易地到达它。但固定化酶有大的实际优势:

  • 酶不被冲走,所以它能一遍又一遍地使用。
  • 产物是纯的——它不与酶混合。
  • 酶更稳定,所以它更好地经受温度和 pH 的变化。
  • 过程可以连续运行,底物流入、产物流出。
一勺白色的生物洗衣粉
生物洗衣粉含有在低温下消化食物和血渍的酶
词汇表 训练
英文 中文 拼音
immobilised enzyme 固定化酶 gù dìng huà méi
alginate 海藻酸盐 hǎi zǎo suān yán
3.2

考试技巧

  • 诱导契合模型解释酶的作用(活性位点围绕底物塑形)——现在比锁钥更受青睐。
  • 在最适温度之上酶变性(氢键和三级结构断裂)——写"变性",绝不写"死了"或"被杀死"。
  • 区分抑制剂:竞争性结合活性位点(被更多底物克服,同样的 $V_{max}$);非竞争性在别处结合(更低的 $V_{max}$)。
  • 初速率(时间零处的切线)比较速率——最公平的量度,在底物变成限制之前。

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