דלג לתוכן

גנטיקה רפואית

רפואה אוניברסיטאית · נושא 6

חומר עזר

מה הקורס הזה הוא, וכיצד להשתמש בו

זהו הקורס השישי בUniversity Medicine: גנטיקה רפואית . MED01 הסביר את המולקולה; קורס זה מסביר את הירישה שלה — איך וריאנטים עוברים דרך משפחות ואוכלוסיות, ואיך הקליניקה קוראת אותם.

גבול היקף, מצוין פעם אחת: קורס לימודים, לא תואר רפואי; כל המקרה למטה הוא בדיוני ואף דבר כאן אינו מעניק רישוי או מדריך לטיפול.

  • היחידות 6.1–6.3 הן כללי העברת גנים: כרומוזומים, מנדל, וה יוצאי דופן.
  • היחידות 6.4–6.5 הן מגוון: סוגי מוטציות ותדירות אוכלוסיות. תדרים.
  • יחידות 6.6–6.7 הן הקליניקה: בדיקות, ייעוץ וה רוב הרב-גורמי.

הרגל התרופתי: כל סיכון הוא הסתברות שאתה מחשב — יחסים של הפרדה, תדרי הרדי-ווינברג, מערכות בייזיות נשאות עדכונים — וכל מספר למטה הוא משהו שתחשב מחדש.

כרומוזומים וקאריאוטיפים

למה זה חשוב. הכרומוזום הוא יחידת ההעברה, ו- מיוזה היא המכונה שמניעה אותו. כאשר המכונה מתקלקלת ה- תוצאה היא טעות במינון כרומוזומלי שלם — התנאים הגנטיים ה- המתאימים לשריד הקיים ביותר.

הרעיון, עם תמונה. הקאריאוטיפ האנושי: 46 כרומוזומים = 23 זוגות (22 זוגות אוטוזומים + XY/XX) ✓, ספירה ב- מטפאזה (מיטוזה MED04). מיוזה: העתקה אחת, שתי- חלוקות → ארבעה גמטות haploid. Non-disjunction — חומצות הדנ גמטות עם כרומוזום אחד יותר או פחות.

מיוזה עם חילוק בלתי-שווה בחלוקה I ו-II, ומספר הגמטות resulting *חילוק שגוי אחד, שתי חלונות (I לעומת II) — וגם יחסים שונים לגמטות מכל אחד

הנגזרת (ה-2:2 וה-1:1:2). חילוק בלתי-שווה בחלוקה I: הזוג ההומולוגי נע יחד → 2 גמטות עם n+1, 2 עם n−1 — התמונה הקלה יותר (חלק מהרקמה הוא אופלואידי). זה גם אזהר את לאחר מכן זוג אחיות נדבק ב-II → 1 גמטה n+1, 1 גמטה n−1, 2 נורמלי — יחס 1:1:2 ✓. תסמונת דאון (טריזומיה 21, ~47,XX/XY,+21; תדירות ≈ 1 ב-700 לידות, עולה עם גיל האם ✓) היא הדוגמה דוגמה נותרה: כ-95 % מהמקרים הם כרומוזום נוסף חופשי 21 מחילוק בלתי-שווה, כ-90 % מהאלו נובעים מהביצה, והרוב מ אלו במיוזה I.

דוגמה מודגמת 1 — כתיבת קריוטיפ. 46,XX = נקבה, סטנדרטי ✓; 47,XY,+21 = זכר, טריזומיה 21 ✓; 45,X = מונוזומיה X (טרנר, הניחונה במלואה המונוזומית היחידה הניתנת לחיים ✓). הסימון הוא משפט: מספר, מגדר, שינוי. אנאפלוידיות כרומוזום מין (47,XXY; 47,XYY; 47,XXX) הן קלות יותר מאוטוזומליות — אינאקטיבציה של X וכרומוזום Y עניין בגנים מעכבים את המינון.

דוגמה מודגמת 2 — קשר קליני: חלון מוסאיזם. (מקרה בדיוני) מאובנים קלים, שני קווי תאים 46/47,+21: התרחשה אי-הפרדה בחלוקה מיטוטית מוקדמת — אירוע פוסט-זיגוטי. מוסאיזם מסביר התמונה הקלה יותר (חלק מהרקמות אופלוידיות). היא מאירה אף את ייעוץ לגבי המקרה ההפוך: הורה יכול לשאת תאים טריסומיים רק באיבר הרבייתי או בביצית (מוזאיקה בקו התאי), כך ש מצב עלול לחזור בילד שני גם כאשר כרומוטות הדם של שני ההורים תקינים. כרומוטות הם נורמליים.

טעויות נפוצות. בלבול בין חלונות המיוזה I ו-II (הגמטה היחסים משתנים: 2:2 מול 1:1:2). כינון תסמונת דאון כ"משפחתית" (זו העובדה ש-1,Y לעולם אינה חיה — X מכילה גנים חיוניים. סיכון גיל אם הוא גבוה יותר. שכחון that 45,Y לעולם לא יהיה חי — X נושא גנים חיוניים.

סיכום. 46 = 23 זוגות; מיוזה I מפרידה הומולוגים, II אחייניות כרומטידיות; אי-הפרדה I → 2×(n+1) ו2×(n−1); II → 1:1:2; טריזומיה 21 (~1/700) הוא הדוגמה הנותרת לאוטוזומל; 45,X היא היחידה ה viable מונוזומיה; מוזייסיזם מקל ומסבך.

ירישה מנדליאנית ומשפחות גנטיות

מדוע זה חשוב. היחסים של מנדל הם המנוע ההיכרתי הרצף של ייעוץ גנטי: בהינתן משפחה, לחשב מי בסיכון. ה משפחת הגנאלוגיה היא מבנה הנתונים; היחסים הם החישוב האריתמטי.

נקבות), X-קשור דומיננטי X (שני המינים מושפעים; אב מושפע מעביר זאת ל-ALL הבנות שלו ול-NONE מהבנים שלו ✓). זכר, עיגולים נקבה; מלא = חולה; קו אופקי = זיווג; קו כפול = אינצטואציה. ארבעה דפוסי גן יחיד: אוטוזומלי דומיננטי (כל דור, M:F שווה, אב-לבן אפשרי; התחלה לעיתים קרובות במבוגרים), אוטוזומלי רצסיבי (התקבצות אופקית, אינצטואציה, 1/4 של אחים), **X-קישור רצסיבי X (ללא זכר-לבן, זכרים חולים קשורים דרך נקבות), _links דומיננטי X (שני המינים פגיעים; אב פוגע כל בתיו ואת כל בניו ✗).

ארבעת דפוסי המשפחת הגנאלוגיה המנדליאנית לצד זה
ארבעה דפוסים, ארבעה חתימות — קראו את הריבועים והעיגולים כמו רנטגן

הגזירה (יחסים מהגמטות). Aa × Aa: גמטות A,a × A,a → AA, Aa, Aa, aa = 3:1 חולה:לא חולה ✓ (דומיננטי); רצסיבי כ-1/4. גיל משנה זאת לפי בייס. נניח (מספר בדיוני) $X^{A}X^{a}$ × אב בריא → בנים 1/2 חולים, בנות 1/2 נשאות ✓ — טבלת פונט לכל דפוס, וכל הערכת סיכון בייעוץ היא אחת מטבלות אלו עמוקה עם חדירות.

דוגמה מופתלת 1 — סיכון לאורך משפחה. (דמיונית) דומה להינטנגטון אוטוזומלי דומיננטי: הורה חולה (Aa) × הורה בריא (aa) → כל ילד 1 % מהנשאים עדיין בריאים בגיל 2. עבור ילד בריא בגיל 25 משפחה זו: 1/2 × 1/2 = 1/4 ✓, מכיוון שב25 הסיכון של ההורה עצמו עדיין כ-1/2. גיל משנה זאת באמצעות באייר. נניח (מספר בדיוני) 20 % מהנשאים עדיין בריאים בגיל 60. עבור ילד בריא בן 60 של ההורה הפוגע: $P(\text{carrier} \mid \text{healthy at 60}) = \frac{\tfrac12 \times 0.2}{\tfrac12 \times 0.2 + \tfrac12 \times 1} = \frac{1}{6}$ ✓. "עדיין בריא" הוא עדות, והוא מזז את הסיכון מ1/2 ל1/6.

אקונדרופלסיה בילד של הורים בממוצע: ~2 % מהמקרים הם מוטציות חדשות אכונדרופלסיה אצל ילד להורים בעלי ממוצע גובה: ~80 % מהמקרים הם מוטציות חדשות מוטציות (השפעת גיל האב) ✓; חזרה בקרב אחים היא כמעט ברמת אוכלוסייה סיכון, אך הילדים של הילד המושפע נמצאים בסיכון 1/2. הבחנה טעויות נפוצות. השוויה בין "דומיננטי" לבין "נפוץ" (מחלות

דומיננטיות לעיתים רבות נדירות ולעיתים רבות הן חדשות). שכחון מוטציות שוברות את המשפחה הקלאסית (ללא הורים חולים). הנחת משפחות קטנות מראות פרופורציות (הסתברויות, לא הבטחות: שלושה ילדים בריאים משפחות מציגות יחסים (הסתברויות, לא ודאויות: שני הורים נשאים על מוטציה ישנם שלושה ילדים בריאים $(3/4)^{3} \approx$ 42 % מה הזמן ✓, ולכן תנאי רצסיבי יכול להתחבא במשפחה קטנה).

סיכום. ארבעה חותמות יחוס; טבלאות פונט נותנת 3:1, 1/4, 1/2-בנים; גיל התחלה ומוטציה חדשה משנים פרופורציות גוליות; סיכון = טבלה × הוכחת יחוס, מעודכן באמצעות בייס.

תורשה לא-מנדלית

למה זה חשוב. המשפחות המסובכות בקליניקה — העברת אם אם, ביטוי לא-שווה, הפתעות של עומס גנטי — אינן כישלון של מנדל אלא שכבות נוספות של העברה שכל פאנל מודרני חייב לפרש. הרעיון, עם תמונה. תורשת מיתוכונדרית:

mtDNA מועבר רק מאם — כל ילדי אם חולה עלולים להיות חולים, אף אחד מאב חולה ✓; הטרו-פלזמיה (אוכלוסיות mtDNA מעורבות) הופכת את החומרה להגרלת מזל. הטבעה גנומית : הביטוי תלוי במקור ההורי (פרדרי-ווילי = ייתכן שיושפע, אף אחד מילדי אב פוגען ✓; הטרו-פלסמיה (תערובת אוכלוסיות mtDNA) הופך את החומרה לגורלת. הטבעה גנומית אנטיציפציה (התחלה מוקדמת וחומרה מוגברת מחיקת 15q אביתרית, אנגלמן = מחיקת 15q אמיתית — אותה אזור, CGG. הרחבת חזרות**: התגיינות (הופעה מוקדמת, עוצמה קווים אם, מקור הורה, וחוזרות מתרחבות — שלושה חותמים שמנדל לא ראה CGG.

טבלה להשוואת הדפוסים שאינם-מנדליים
קווים אמיים, תלות באב, והרחבת חזרות — שלוש חתימות שמנדל מעולם לא ראה

הגזירה (למה מקור ההשפעה חשוב). גנים מודפסים מושקעים על ידי מתילציה (אפיגנטיקה של MED01) שנקבעו בגרמינה ו- מוגדרים מחדש בכל דור: רק העתק אחד מההורים פעיל. מחיקת העתק הפעיל → מחלה, ולכן אותה מחיקה בכרומוזום האבי (ללא עתק פעיל, פרדו–וילי) שונה מזאת האםיתית (ללא עתק פעיל של גן אחר, אנגלמן) ✓. דיסומיה חד-הוריונית (שתי העתקים מאב אחד) חוקה מחיקה: שתי עתקים מושקעים. (שתי העתקים מאב אחד) מדמה מחיקה: שני עתקים שקטים.

דוגמה פתורה 1 — מתמטיקה של התגיינות. (בדיונית) צרעת X שבירה משפחתית: אם עם פרמווטציה (55–200 CGG) מעבירות הרחבה (>200, מוטציה מלאה) עם סיכון ההרחבה העולה עם אורך החזרה ✓. הנטנגטון: העברה אביתרית של CAG גדול (>60) לרוב גורמת הציפוי נמדד, ולא אגדה. התגיינת היא נמדדת, לא אגדה.

דוגמה פתורה 2 — קשר קליני: הקו האמי בלבד. (הדודה חסה, האם סוכרת, הדוד נפגע מוחי) — מוטציה אחת, פנוטיפים רבים, כי כל ילד מדגם חלק שונה של שריפת הבקבוק של mtDNA מוטנטי. יורשת מיטוכונדריאלית. הטרו-פלסמיה מסבירה את התפוצץ בחומרת (הדודה עיוורת, האם סוכרת, הדוד מוחי) — מוטציה אחת, פנוטיפים מרובים, משום שכל ילד דוגם חלק צווינץ!י של mtDNA מוטנט.

שגיאות נפוצות. ציפייה שהמחלה במיטוכונדריה תפגע בכל ילדי האם הנפגעת באופן שווה (הטרו-פלזמיה). בלבול בין אימפרινטינג לבין דומיננטי/רצסיבי (שניהם יכולים להיות דומיננטיים; הורה מה מי מוביל הוא המפתח). התנהגות כעויון גילוי (זו בעיה אמיתית של חוסר יציבות במיוזה).

סיכום. מיטוכונדריה: תורשת אם בלבד, לוטו הטרו-פלזמיה; אימפרין: אותה מחיקה, הורה מנוגד, תסמונה מנוגדת (15q); חזרה חזרות: אנטסיפציה, פרמוטציה→סיכון מוטציה מלאה לפי אורך.

פרשנות מוטציות וVariants

למה זה חשוב. ריצוף זיהה את הVariant; הקליניקה צריכה לדעת אם זה משמעותי. פרשנות Variant היא ליבה אינטלקטואלית יומיונית בגנטיקה רפואית — שרשרת הוכחות מדורגת, לא כן/לא.

הרעיון, עם תמונה. סוגי Variant על מודל גן: סינונימי (שינוי חומצה אמינית), מיסנס (שארית אחת), נונסנס (עצירה; בדרך כלל חמור — קיצור), פריימשיפט (indel שאינו מכפלה של 3), ספלייס, עבור **וריאנטים במספר העת (CNVs: מחיקות/הכפלות של אקסונים או גנים שלמים). דירוג: פתוגני, סבן לפתוגני, ווריאנט בעל חשיבות לא ודאי (VUS), סבן ללא-פתוגני, ללא-פתוגני — לפי אוכלוסיית משמעות (VUS), ככל הנראה שפיר, שפיר — לפי אוכלוסייה אוכלוסייתי, חיזוי מחושב, נתונים פונקציונליים, הפרדה, ועוד הקשר המוסכם של הגן למחלה ✓.

מודל גן מותאם עם סוגי וריאנטים
גן אחד, חמישה דרכים לשבור אותו — ומדד דירוג מחולק לחמש רמות

המסקנה (מדוע תדירות היא המסנן הראשון). וריאנט נפוץ באוכלוסיות בריאות (למשל >1 %) אינו יכול לגרום לחולשה נדירה מחלה מוקדמת: הכללים האריתמיטיים שוללים אותו לפני כל תחזית חיזוי כלשהו פועל. לכן תדירות האלל במאגרי נתונים אוכלוסייתיים (gnomAD) שולטים בעברת הבדיקה הראשונה; וריאנטים שנחשבו לפוגעים אך הם בדרך כלל רקעי ברקע ✓. לקחת מחלה דומינת המשפיעה על 1 person in 10 000 and a variant carried by 1 person in 100. Even if אף אם וריאנט זה אחד גרם לכל המקרים, רק $\frac{1/10\,000}{1/100} = \frac{1}{100}$ מנשאי המוטציה עשויים להיות מושפע ✓ — ולכן אינו יכול להיות גורם חדשני לחלוטין.

דוגמה מפורשת 1 — הרצאה על VUS. (בדיוני) וריאנט VUS מסוג missense ב גן סרטן השד שנמצא באישה חולה: התשובה הנכונה היא לא לטפל בו כפיתולי. בדיקת קשירה לאח מצוין ב-VUS; פרשנות הווריאנט עשויה להשתדרג מאוחר יותר על ידי הפרדה (האם היא מתעקבת אחר המחלה?) ואיסוף נתוני מקרים ✓. שפה בייעוץ: "מצאנו שינוי רישום; אנחנו עדיין לא יודעים אם זה משהו." נתונים ✓. שפת ייעוץ: "מצאנו שינוי בכתיב; אין לנו עדיין לא יודעים אם זה משהו."

דוגמה מודגמת 2 — קשר קליני: חוק אובדן הפונקציה. (דמיוני) וריאנט תסרוכי מוקדם בגן שמונגנונו המבוסס המנגנון הוא חצי-חסר (עתה אחת פעילה היא מספיק — למשל PAX6 באנירידיה): וריאנט מקצר במין כזה הוא עלול להיות חזק לאבחון פתוגני. הכלל: מנגנון גנטי (חיסול חצי-אללי לעומת שלילי-דומיננטי או רצסיבי) חוזה אילו סוגי וריאנטים חשובים בגן זה.

שגיאות נפוצות. היחס ל-VUS כ"ככל הנראה מחולל" (הוא בלתי ידוע במפורש — הכישלון הנפוץ ביותר בייעוץ). יישום לוגיקה של שלילי-דומיננטי לגנים עם חסר חומצה. שכחון כי וריאנט יכול להיות מחולל למחלה אחת ואינו-מחולל למחלה אחרת (או רצסיבי — נשא ללא אלל שני).

סיכום. חמישה סוגי וריאנטים על פי דגם גני; קנה מידה בעל חמישה שלבים; תדירות אוכלוסייתית תחילה (בייז), לאחר כך חיזוי, פונקציה, הפרדה; VUS נשאר VUS עד שהעדויות מזיזות אותו; מנגנון הגן קובע אילו סוגי וריאנטים נספרים.

גנטיקה אוכלוסייתית

למה זה חשוב. תדירות אללים הופכת סיכוני נשיאה לחישוביים לפני כל היסטוריה משפחתית — החישוב המתמטי מאחורי בדיקות תנועה, פאנלי נשיאים וייעוץ על בסיס תפוצה אתנית. משוואה את העבודה.

הרעיון, עם תמונה. איזון היארדי–ווינברג-: $p^{2} + 2pq + q^{2} = 1$ — תדירות גנוטיפים מתוך אללים תדירויות, יציבות דור לדור אם הזווגה היא אקראית, האוכלוסייה גדולה ואין ברירה/הגירה/מוטציה ✓. אוכלוסייה גדולה, וללא בחירה טבעית/הגירה/מוטציה ✓.

תדירות אללים וגנוטיפים תחת Hardy–Weinberg המסקה (למה מופיע הבינומי). איחוד אקראי של

גרמות הוא ניסוי בינומי: שני אללים, תדירות p ו-q, ולכן הגמטות הן גרירה דו-מוניאלית: שני אללים, בתדרים p ו-q, ולכן P(AA) = p², P(Aa) = 2pq, P(aa) = q² ✓ — ה2 מייצג את נשאי הכפילות סדרים. פיברוזיס כיסתי: q² ≈ 1/2500 (אירופה הצפונית) → q ≈ 1/50 → נשאים 2pq ≈ 1/25 ✓ — שיעור הנשיאה המפורסם של 4 % ממחלה תדר. תכונת קוצב סקולרי באוכלוסיות מערב אפריקאיות ~1/4 נשאים: q מתוך 2pq, והיתרון ההטרוזיגוטי (נשאים עמידים למלריה) מסביר למה האלל נשאר נפוץ שם למרות שההומוזיגוט נבחר נגדו. נגד.

דוגמה פתורה 1 — חשבון סיכון נשיאה. אישה ללא CF (סיכון שארית לאחר בדיקה שלילית ≈ 1/25 עם זיהוי מודרני): (סיכון שארית לאחר בדיקה שלילית ≈ 1/300: פאנל שמזהה 92 % של נשאים משאיר $\frac{(1/25)(0.08)}{1 - (1/25)(0.92)} \approx \frac{1}{300}$): סיכון ילד חולה = 1/25 × 1/300 × 1/4 ≈ 1/30 000 ✓ — כל התעשייה לבדיקות נשיאות היא כפל אחד זה.

דוגמה פתורה 2 – קשר קליני: השארית הבדוקה. (דמות בדיונית) זוג שבו אחד משני השותפים הוא נשא ידוע והשותף מבצע בדיקה שלילית: הסיכון ≈ 1 × שארית(1/300) × 1/4 ≈ 1/1200 ✓. מדוע לא אפס? האבחון אינו מושלם (CNVs, וריאנטים נדירים בקדד); ה שארית היא ספציפית לגן ולפנל — הייעוץ מציין אותה, לעולם "אין סיכון".

טעויות נפוצות. פתרון q = √(תדירות) כאשר נתונה תדירות נשאים (נשאים הם 2pq, לא q²). יישום איזון כשהבחירה מעוותת (אזורי דרקון, אוכלוסיות מייסדים). שכחתי אפקטי מייסדים מתרכזים אללים נדירים (Tay–Sachs ~1/30 נשאים ב יהודי אשכנז מול ~1/300 באוכלוסייה הכללית ✓).

סיכום. $p^{2}+2pq+q^{2}=1$; תדירות מחלה → q = √(מחלה) → נשא = 2pq; שארית הסיכון לאחר מסכינים שליליים מצוינת, לא אפס; בחירה ואפקטי מייסדים הם הסטיות התקניות מהאיזון. איזון.

בדיקות גנטיות וייעוץ

מדוע זה חשוב. תוצאת בדיקה היא מידע על משפחה, לא רק על מטופל — וכל שיטה רואה שכבה שונה של הגנום. בחירת הבדיקה והייעוץ בתוצאות הם המיומנויות הקליניות.

הרעיון, עם תמונה. שיטות: קריוטיפing (פיזור במטאפזה; רואה ≥ ~5–10 Mb, עיוותים מאוזנים), מיקרו-אראי (CMA: CNVs עד ~50–100 kb; אין עיוותים מאוזנים ✓), FISH (ממוקד; אנאפלוידיות מהירה או) מבנה גנטי ✓), FISH (מוכוון; זיהוי מהיר של אנאופלוידיות או ארבע חלונות על הגנום, ארבע רזולוציות — השאלה בוחרת את החלון המסקור (למה הרזולוציה מתחלפת עם ההיקף). קריאוטייפ רואה את כל הגנום ברזולוציה נמוכה (שינויים מבניים גדולים ומאוזנים); רצף רואה פרטים ברמת בסיסים באזורים שבו הוא מכסה; CMA מכסה את הגנום ברזולוציה בינונית אך מחמיץ שינויים מאוזנים (אין סטיית מינון נטו). לא נבחון יחיד רואה הכל — השאלה הקלינית מכוונת לשיטה שתוכל לענות עליה ✓. כיוון זה הוא ההחלטה הראשונה של המעציץ, לפני חתימת טופס הסכמה. קריאוטייפ / FISH / QF-PCR; עיכוב התפתחותי → CMA; ידוע במשפחה וריאנט → סנגר ממוקד ✓.

טבלת השוואה של שיטות הבדיקה
ארבעה חלונות בגנום, ארבע רזולוציות — השאלה קובעת את החלון

המסקר (למה הרזולוציה מחליפה תחום). הקריאוטייפ רואה את כל הגנום ברזולוציה נמוכה (שינויים מבניים גדולים ואוזנים); רצף רצפים רואה פרטים ברמת בסיס באזורים שהוא מכסה; CMA מכסה את הגנום ברזולוציה בינונית אך מפספס שינויים מאוזנים (ללא חוסר איזון כמותי). אין בדיקה אחת שרואה הכל — השאלה הקלינית מתאימה לשיטה שתוכל לענות עליה ✓. התאמה זו היא ה החלטה הראשונה של המדריך לפני כל טופס הסכמה.

דוגמה מודגמת 1 — הסדרה העקיפה. (בדיונית) וריאנט BRCA1 פתוגני משפחתי: תוצאה חיובית של החולה הראשון יוצרת סיכון נבדק (1/2 לכל בן משפחה מדרגה ראשונה) — בדיקות סדרה בני משפחה שנבדקו שלילי חוזרים לסיכון אוכלוסייתי עבור מנגנון זה (ולהפך). להעיד לבן משפחה שנבדק שלילי לוריאנט המשפחתי שהם syndrome ✓. The pedigree multiplies the value of one result.

דוגמה מפורטת 2 — קשר קליני: האינצינטלומה. (בדיונית) א גנום מרוצף בגליליה התפתחותית מגלה נטייה למחלת בוגרים באופן מקרי: הקליניקה חייבת להחליט מה לעלות. הסכמה לפני בדיקה קובעת את התפריט; דוח עשיר ב-VUS מסופר שכן כבלתי ודאי, לא מאיים — ותוצאות ילדים נדחות גילויים של מחלות בוגרים ככל האפשר ✓.

טעויות נפוצות. הזמנת ריצוף כאשר CNV הוא המנגנון הסביר יש להם "אין סיכון" (הם חוזרים לסיכון אוכלוסייתי, שהוא אינו אפס). לשכוח שהוא אינו אפס). שכחתי בדיקות פרה-סימפטומטיות לילדים מוגבלות למצבים עם פעילות בילדות ✓.

סיכום. קריאוטיפ (גדול/מאוזן), CMA (CNV על פני הגנום) FISH (ממוקד ומהיר), ריצוף (רמת בסיס, תחום שנבחר); השאלה בוחרת את השיטה; בדיקות קסקדיות כופלות תוצאה אחת; הסכמה והאינצינטלומה הן חלק מהבדיקה.

מחלה רב-גורמית ופארמקוגנומיקה

למה זה חשוב. רוב המחלות הנפוצות — סוכרת, לחץ דם, אסמה, שזופרניה — ורוב תגובות התרופות הן רב-גורמיות: מספר גנים בעלי השפעה קטנה onClick סביבה. הקליניקה זקוקה לדגמים הופך את הביטוי "תכונה משפחתית" למדד כמותי.

הרעיון, עם תמונה. מודל מתחם הסיכון : סיכון = תרומות גנטיות + סביבתיות (סכום הקרוב להתפלגות נורמלית); מחלה מתרחשת כאשר הסיכון עובר את הסף ✓. סיכוני חזרה אנפיריים: 2–5 % עבור רוב עלייה עם (25) יותר בני משפחה affected, (50) צורה חמורה יותר ב עלייה עם (1) יותר קרובים חולים, (2) צורה חמורה יותר ב אדם נפגע, ו(3) אדם נפגע ממי שמוחלה פחות לעיתים מין ✓. הכלל השלישי הוא אפקט קארטר: צרור פתח הקיבה נפוץ פי ארבעה יותר בקרב בנים, לכן בת שנפגעת חייבת לשאת עומס סיכון גבוה יותר, והסיכון של קרוביה גדול יותר.

התפלגות הסיכון עם הסף שלה
עקומה נורמלית של סיכון תורשתי+סביבתי; הזנב מעבר לסף הוא המחלה

פארמאקוגנומיקס: מרשם המונחה על גנוטיפ — הדוגמאות המאושרות ביותר: CYP2C19 קלופידוגרל (מטבוליזרים לקויים אינם מסוגלים להפעיל את הפרודרוג), TPMT/תיופרינים (רעילות חמורה ב חסר), HLA-B*57:01 היפר-רגישות לאבקוויר (בדיקה לפני המרשם ✓).

הנגזרת (מדוע הסיכונים עולים בכל מקרה). אם ההורים של ילד פגוע יושבים מעל הממוצע בסיכון, קרובים נוספים פגועים מרימים את הסיכון המשפחתי המופק — כל ההתפלגות זזה ימינה, ויותר אחים עוברים את הסף: אנפירי 2–5 % למקרה אחד עולה לעבר 5–10 % עם שניים ✓. זה זוהי הסיבה שיעוץ רב-גורמי מצטט טבלאות אמפיריות (מחקרי אוכלוסיה), ולא יחסי מנדל: מיקומים גנטיים רבים בעלי השפעה קטנה אינם מחקרים), לא יחסים של מנדל: רבים מהמיקומים בעלי השפעה קטנה אינם מתפרקים 1:2:1.

שני ילדים נפגעें: ~1 % ✓. ההצטטות היא מתוך טבלאות אוכלוסיה, עם תקלה בשורש עצבי: הישנות אמפירית ~2–4 % (חומצה פולית מפחיתה זאת); שני ילדים שנפגעו: ~10 % ✓. ההערכה מבוססת על טבלאות אוכלוסייתיות, דוגמה פתורה 4 — הקשר הקליני: תרופה מסוננת. (דמיונית) מטופל פסיכיאטרי המתחיל טיפול דמוי קלודופיגרל:

דוגמה מודגמת 2 — קשר קליני: המינון שנבדק. (בדיונית) מטופל התחיל לקלופידוגרל לאחר התקנת סנטר קורונרי: גנוטיפ CYP2C19 כמעט-מתמץ → תרופת אנטי-פלטה חלופית מהיום הראשון, שכן הפרודרוג מעט מאוד מופעל. כ-15 % של מזרח האסיה הם כמעט-מתמצים (שני אללים לאובדן פונקציה), מול כ-2 % של אירופאים ✓. HLA-B*57:01 לפני אבקאווייר: המבחן מונע את רגישות יתר.

שגיאות נפוצות. הצגת 50 %/25 % למשפחות רב-גורמיות (אלו מספרי מנדל; רב-גורמי היא אמפירית 2–5 %). חיבור "סיכון גנטי" ו"סביבתי" כאחוזים במקום נזקים. טיפול בתוצאת פארמקוגנומיקה כאבחון מחלה (זהו הנחיה לכמות תרופה).

סיכום. נזק (≈ רגיל) × סף = רב-גורמי מחלה; תדירות אמיפירית 2–5 %, עולה עם הערכה ומצוקה; חומצה פולית ללא קשר לסיכון; פארמהגנומיקה (CYP2C19, TPMT, HLA-B*57:01) המרת גנוטיפ למינון מרופא.

מילון מונחים
English עברית
medical genetics גנטיקה רפואית
karyotype כרומוזוטיפ
meiosis/meɪˈəʊsɪs/ מיוזה
nondisjunction/ˌnɒndɪsˈdʒʌŋkʃn/ אי-התנתקות כרומוזומלית
germline mosaicism מוזאיקיזם גרמי
pedigree עץ משפחתי
autosomal dominant דומיננטי אוטוזומלי
autosomal recessive רסיבי אוטוזומלי
X-linked recessive קישור X רסיבי
X-linked dominant דומיננטי בקישור ל-X
carrier/ˈkærɪə/ נושא
mitochondrial inheritance תורשה מיטוכונדרית
genomic imprinting הטבעה גנומית
trinucleotide repeat expansion הרחבת חוזרות תרי-נוקלאוטידיות
anticipation/ænˈtɪsɪpeɪʃn/ אנטיציפציה
synonymous סינונימי (עוקב)
missense מיסנס
nonsense ננסנס
frameshift/ˈfreɪmʃɪft/ שינוי מסג
splice אתר גימור
copy number variant ויריאנט תכולת העתקה
variant of uncertain significance ויריאנט בעל חשיבות לא ברורה
haploinsufficiency חפלואינסופיצינסי
Hardy–Weinberg equilibrium איזון הרדי-וויינברג
karyotyping כריאותיפייטינג
microarray/ˈmaɪkrəʊəreɪ/ מיקרו-אראי
FISH/fɪʃ/ FISH
sequencing/ˈsiːkwənsɪŋ/ רצף
liability threshold model מודל סף נשאלות
Carter effect אפקט קטר
pharmacogenomics פארמקוגנומיקה

שיעורים אינטראקטיביים בנושא זה

לעבור על הדברים צעד אחר צעד, עם תרגילים לבדיקה מיידית.

נושאים נוספים ברפואה אוניברסיטאית

היכנס או צור חשבון

IGCSE, A-Level & AP