חומצות אמינו
הוצג| English | משמעות |
|---|---|
| amino acid/əˈmiːnəʊ ˈæsɪd/ | חומצה אמינית |
| peptide bond/ˈpeptaɪd bɒnd/ | קשר פפטידי |
| zwitterion/zwɪˈtɪərɪən/ | זוויטריון |
| isoelectric point/ˌaɪsəʊˈlektrɪk pɔɪnt/ | נקודת איזואלקטרית |
| electrophoresis/ɪˌlektrəʊfɔːˈriːsɪs/ | אלקטרופורזה |
בונה-הבסיס של חלבונים
- ל-חומצה אמינו יש גם קבוצה בסיסית –NH₂ וגם קבוצה חומצית –COOH.
- המטען שלה תלוי ב-pH.
- חומצות אמינו מתחברות לחלבונים באמצעות קשרי פיפטיד.
מעבדת חומצות אמינו
מיינות את התנהגות חומצת האמינו לפי הקבוצה המגיבה.
חומצה אמינית מכילה:
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
היותם של שני הקבוצות האלו היא מה שמאפשר לחומצות האמיניות להתנהג כפי שהן עושות (צ'וויטריונים, קשרי פפטיד).
חומצות אמינו מכילות גם קבוצת אמינו וגם קבוצת חומצה קربוקסילית.
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
הן יכולות לפעול גם כחומצה וגם כבסיס (ציטריונים).
ציוניונים ונקודת השוויון החשמלי
- ה**–COOH** יכול לתת את ה$\text{H}^+$ שלו ל**–NH₂** באותו המולקולה → נוצר ציוניון ($\text{H}_3\text{N}^+\text{–CHR–COO}^-$): לשני הקצוות מטען, אך מטען כולל אפס.
- בתנאי חומצי (pH נמוך): מקבלת $\text{H}^+$ → חיובי.
- בתנאי בסיסי (pH גבוה): מאבדת $\text{H}^+$ → שלילי.
- בנקודת השוויון החשמלי: רוב המולקולות הן ציוניונים, ולכן אין מטען נטו.
חומצה אמינית היא חיובית, זווטריונית או שלילית בהתאם ל-pH
צ'וויטריון הוא:
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
ה–COOH מעביר H⁺ ל–NH₂, כך ששני הקצוות טעונים אך המולקולה כולה ניטרלית.
בתמיסה חומצית (pH נמוך), חומצה אמינית היא:
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
בחומצה הוא מקבל H⁺ (חיובי); באלקלי הוא מאבד H⁺ (שלילי); בנקודה האיזואלקטרית הוא ניטרלי.
התאם כל מונח למשמעות שלו.
Difficulty 2/5 · 140 coins + a small bonus on first completion today
כל פריט מקשר את המונח למשמעותו הנכונה.
קשרי פפטיד
- שתי חומצות אמיניות נמצבות ביחד על ידי התכנסות (איבוד מים) ויוצרות קשר פפטיד (קשר אמיד) → דיפפטיד.
- החזרת תהליך זה בונה פוליפפטיד, ולאחר מכן חלבון.
שתי חומצות אמיניות מתכנסות ליצירת קשר פפטיד
שני חומצות אמינו נמצמדים באמצעות:
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
קונדנסציה בין –COOH ל–NH₂ יוצרת קשר פפטידי (אמיד) ומשחררת מים.
דוגמה מופת: אלקטרופורזה
- אלקטרופורזה מפרידה בין חומצות אמיניות לפי מטען בטמפרטורת pH נבחרת.
לגליסין יש נקודת איזו-אלקטרוסטטית של כ-pH 6.
- ב-pH 2 (מתחת ל-nI): המטען שלה הוא חיובי → היא זזה אל האלקטרודה השלילית (קתודה).
- ב-pH 11 (מעל ה-nI): המטען שלה הוא שלילי → היא זזה אל האלקטרודה החיובית (אנודה).
- ב-pH 6 (ה-nI שלה): אין מטען נקי → היא נשארת במקום.
לכן הכיוון והמרחק שהיא עברה מזהים את החומצה האמינית.
אלקטרופורזה מפרידה בין חומצות אמיניות לפי מטען
הבנתך מושלמת
- לחומצה אמינית יש –NH₂ (בסיסי) ו**–COOH** (חומצי).
- זווטריון = אין מטען נקי; חיובי בחומץ, שלילי בממס בסיסי; ניטרלי בנקודת האיזו-אלקטרוסטטית.
- שתי חומצות אמיניות מתכנסות ליצירת קשר פפטיד (קשר אמיד), באיבוד מים.
- אלקטרופורזה: מתחת ל-nI → זזה לקתודה; מעל ל-nI → אנודה; ב-nI → נשארת במקום.