ระดับสูง: กรดอะมิโนเชื่อมต่อกันเพื่อสร้างโพลีเปปไทด์
แนะนำใหม่| English | ความหมาย |
|---|---|
| amino group/əˈmiːnəʊ ɡruːp/ | หมู่อะมิโน |
| peptide link/ˈpeptaɪd lɪŋk/ | ลิงก์เปปไทด์ |
อะไรจะอธิบายการสังเกตนี้ได้?
- ระดับสูง: ไกลซีน H₂N–CH₂–COOH มีหมู่ฟังก์ชันที่แตกต่างกันสองหมู่ในหนึ่งโมเลกุล ujung氨基และ末端羧酸使之能与其他氨基酸连接并释放水
- เริ่มต้นด้วยการทำนาย ระบุปริมาณหรือลักษณะที่คุณจะเปรียบเทียบ แล้วตัดสินใจว่าหลักฐานอะไรที่จะแยกแยะคำอธิบายสองแบบได้
สร้างโมเดล
- กรดอะมิโนมี หมู่氨基 และหมู่羧酸 ในตัวอย่างไกลซีนที่ระบุ หมู่氨基คือ H₂N– และหมู่羧酸คือ –COOH โดยมี CH₂ อยู่ระหว่างกัน การกลั่นตัวเชื่อมคาร์บอนคาร์บอนิลที่มาจาก羧酸ของโมเลกุลหนึ่งกับไนโตรเจน氨基ของอีกโมเลกุลหนึ่ง การเชื่อม C(=O)–NH คือ จุดเปปไทด์ การเชื่อมซ้ำๆ เกิดเป็นโพลีเปปไทด์ สำหรับไกลซีนแสดงด้วยส่วนภายในซ้ำ –NH–CH₂–C(=O)–
- หมู่氨基: หมู่ฟังก์ชันที่contains nitrogen –NH₂ ในโครงสร้างกรดอะมิโนที่ระบุ; จุดเปปไทด์: จุดเชื่อม C(=O)–NH ที่เกิดระหว่างหน่วยย่อยของกรดอะมิโนที่ระบุโดยการกลั่นตัว
ลิงก์ใดเชื่อมหมู่เอมิโนแอซิดในโพลีเปปไทด์ที่ระบุ?
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
กรดอะมิโนเกิดปฏิกิริยาลดทอนระหว่างหมู่เอมีนของตัวหนึ่งและหมู่คาร์บอกซิลของอีกตัวหนึ่ง สร้างพันธะเปปไทด์ C(=O)-NH พันธะอัลคีนไม่มีบทบาท และไอออนอิสระไม่ได้สร้างพันธะ
จับคู่แต่ละคำศัพท์เทคนิคกับความหมายที่แม่นยำ
Difficulty 2/5 · 140 coins + a small bonus on first completion today
ใช้นิยามเพื่อแยกแยะปริมาณและกระบวนการที่เกี่ยวข้อง
เลือกหลักฐานมาทดสอบสมมติฐาน
- แต่ละเหตุการณ์การเชื่อมต่อสูญเสีย OH จาก羧酸หนึ่งตัวและ H จาก氨基หนึ่งตัวเป็น H₂O โซ่สามารถขยายได้เพราะมีหมู่ฟังก์ชันเหลืออยู่ที่ปลาย โมเลกุลกรดอะมิโนต่างกันสามารถรวมกันในโซ่เดียวเพื่อสร้างโปรตีน; ลำดับและการพับตัวของมันส่งผลต่อโปรตีนที่เกิดขึ้น การซ้ำแต่ไกลซีนเป็นเพียงแบบจำลองอย่างง่าย ไม่ใช่ข้ออ้างว่าโปรตีนธรรมชาติทุกชนิดมีหน่วยย่อยกรดอะมิโนซ้ำชนิดเดียว การจัดหมวดหมู่โครงสร้างโปรตีนรายละเอียดเช่น zwitterion, stereochemistry ไม่จำเป็นในที่นี้
- ใช้บัตรกรดอะมิโนที่ติดฉลากโดยแยกแยะปลาย氨基และ羧酸 สร้างโซ่เปิดสั้นๆ ทำเครื่องหมายจุดเปปไทด์แต่ละจุด รักษาคู่พันธะคาร์บอนิลและบันทึกน้ำแต่ละโมเลกุล จากนั้นสร้างโซ่โดยใช้ฉลากกรดอะมิโนหลายชนิดเพื่อแสดงความหลากหลายของลำดับ แยกหลักฐานทางเคมีออกจากข้ออ้างด้านอาหาร: การระบุพันธะเปปไทด์ไม่ยืนยันบทบาททางชีววิทยา คุณค่าทางโภชนาการ หรือความปลอดภัยของตัวอย่างที่ไม่รู้จัก
นิสัยสองอย่างใดทำให้การตรวจสอบหรือแบบจำลองในกรณีนี้รองรับได้มากขึ้น?
Difficulty 2/5 · 140 coins + a small bonus on first completion today
การระบุเงื่อนไขและสมมติฐานช่วยให้ผู้อื่นทำงานซ้ำได้โดยถูกต้อง และการบันทึกหลักฐานรองรับช่วยให้พวกเขาตรวจสอบข้อสรุปได้ การซ่อนผลลัพธ์ที่ขัดแย้งกันจะกำจัดหลักฐานที่อาจทลายข้อสรุปที่ผิดพลาด และข้อมูลจากตัววัดเพียงหนึ่งค่าไม่สามารถใช้ยืนยันข้ออ้างที่กว้างขวางได้
ทำงานจากปริมาณที่ทราบค่า
- ระบุค่าที่ทราบและหน่วยของมัน เลือกความสัมพันธ์โดยพิจารณาว่าข้อสมมติฐานสอดคล้องกับเคสนี้ แล้วจัดรูปสมการก่อนแทนค่า
- ทราบแล้ว: ไกลซีนสี่ตัวสร้างโซ่เปิดที่มีขนาดจำกัดพร้อมสามจุด เชื่อมกัน ปล่อยน้ำสามโมเลกุล โดยใช้มวลสัมพัทธ์ที่จ่ายให้ ไกลซีน=75 และน้ำ=18 มวลสัมพัทธ์ของโซ่คือ 4×75−3×18=246 การคำนวณนี้รวมกลุ่มปลายที่เหลืออยู่ไว้ด้วย ต่างจากการคูณมวลหน่วยซ้ำภายในในอุดมคติเพียงอย่างเดียว แสดงถึงการอนุรักษ์มวล; มวลที่ลดลงอยู่ในน้ำ ไม่ใช่อะตอมที่ถูกทำลาย
ไกลซีนห้าตัวสร้างโซ่เปิดพร้อมสี่จุด เชื่อมกัน ให้มวลสัมพัทธ์ 75 และน้ำ 18 คำนวณมวลสัมพัทธ์ของโซ่ ใช้ลำดับเดียวกัน: ปริมาณที่ทราบ → แบบจำลอง → ความสัมพันธ์ → แทนค่า → หน่วยและการตีความ
โมเลกุลของไกลซีน 5 ตัวสร้างโซ่เปิดด้วยลิงก์ 4 ลิงก์ กำหนดให้มวลสัมพัทธ์ของ 75 และน้ำ 18, คำนวณมวลสัมพัทธ์ของโซ่
Difficulty 2/5 · 140 coins + a small bonus on first completion today
ผลลัพธ์คือ 303 ที่ทราบ: 5 โมเลกุลกลีซีน (มวลสัมพัทธ์ 75 ต่อโมเลกุล) เชื่อมต่อกันด้วย 4 จุดเชื่อมโยง, หายไป 4 โมเลกุลน้ำ (18 ต่อโมเลกุล) มวลของสายโซ่ = 5 x 75 - 4 x 18 = 375 - 72 = 303 “มวลที่หายไป” ถูกเก็บรักษาไว้ในรูปของน้ำที่ถูกปล่อยออกมา
ตรวจสอบข้อสรุปและขอบเขต
- จุดเปปไทด์ C(=O)–NH แตกต่างจากจุดเอสเทอร์ C(=O)–O อย่าลบออกซิเจนคาร์บอนิลออกหรือสูญเสียหมู่氨基ทั้งหมู่ การคำนวณน้ำหนึ่งโมเลกุลต่อจุดสำหรับโซ่ที่มีขนาดจำกัดไม่รวมการจัดเรียงแบบวงแหวนหรือมีกิ่งก้าน เคมีการกลั่นตัวของกรดอะมิโนเป็นเฉพาะระดับสูง (HT) แต่การรับรู้กรดอะมิโนเป็นโมโนเมอร์ของโปรตีนใน 4.7.3.4 สามารถใช้ได้ทั้งสองระดับ
- กลับไปที่การสังเกตเดิม อธิบายว่าผลลัพธ์นี้สนับสนุนสิ่งใด มีเงื่อนไขใดบ้าง และเป็นอย่างไรในการทดสอบคำอธิบายอื่นที่ขัดแย้งกัน
การสร้างพันธะเปปไทด์จะทำให้ไนโตรเจนทั้งหมดจากกรดอะมิโนหายไป ข้ออ้างนี้ไม่ถูกต้อง: พันธะเปปไทด์เกิดขึ้นระหว่างไนโตรเจนของหมู่เอมีนกับคาร์บอนของหมู่คาร์บอกซิล ไนโตรเจนยังคงอยู่ในสายโซ่ในรูป N-H ของแต่ละพันธะ ไม่มีไนโตรเจนใดถูกลบออก
ระดับสูง: กรดอะมิโนเชื่อมต่อกันเพื่อสร้างโพลีเปปไทด์: ในแต่ละเหตุการณ์การเชื่อมต่อจะสูญเสีย OH จากหมู่กรดคาร์บอกซิลิกหนึ่งตัวและ H จากหมู่เอมีนหนึ่งตัวเป็น ₂O. โซ่สามารถยืดได้เนื่องจากกลุ่มฟังก์ชันยังคงอยู่ที่ปลายโซ่ กรดอะมิโนที่แตกต่างกันสามารถรวมกันอยู่ในโซ่เดียวกันเพื่อสร้างโปรตีน; ลำดับและการพับตัวของมันส่งผลต่อโปรตีนที่เกิดขึ้น การซ้ำซ้อนด้วยไกลซีนเพียงอย่างเดียวเป็นแบบจำลองอย่างง่าย ไม่ใช่ข้ออ้างว่าโปรตีนธรรมชาติทุกชนิดมีกรดอะมิโนชนิดเดียวที่ซ้ำกัน ไม่จำเป็นต้องรู้รายละเอียดเกี่ยวกับไซโตไลออน ส터ริโอเคมี และการจัดหมวดหมู่โครงสร้างโปรตีนในหัวข้อนี้
การสร้างลิงก์เพปไทด์ทำให้สูญเสียไนโตรเจนจากกรดอะมิโนทั้งหมด
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
พันธะเปปไทด์เกิดขึ้นระหว่างไนโตรเจนของหมู่เอมีนและคาร์บอนของหมู่คาร์บอกซิล ไนโตรเจนคงอยู่ในสายโซ่ในฐานะ N-H ของทุกพันธะ ไม่มีไนโตรเจนใดถูกลบออก
หมู่ฟังก์ชัน –NH₂ ที่มีไนโตรเจนในโครงสร้างกรดอะมิโนที่ระบุ: เขียนคำศัพท์เทคนิค
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
หมู่เอมิโน หมายถึง หมู่ฟังก์ชัน –NH₂ ที่มีไนโตรเจนในโครงสร้างกรดอะมิโนที่ระบุ