Gene expression: regulate products, not just genes
แนะนำใหม่| English | ความหมาย |
|---|---|
| transcription factor/trænˈskrɪpʃn ˈfæktə/ | แฟกเตอร์การถอดรหัส |
| epigenetic modification/ˌepɪdʒɪˈnetɪk ˌmɒdɪfɪˈkeɪʃn/ | การดัดแปลงทางอณูพันธุศาสตร์ |
อะไรจะอธิบายการสังเกตนี้ได้?
- เซลล์สองเซลล์ที่มี genome เดียวกันสามารถสร้างโปรตีนได้ต่างกัน การควบคุมเปลี่ยนแปลงข้อมูลที่ใช้และเวลาในการใช้
- เริ่มต้นด้วยการทำนาย ระบุปริมาณหรือลักษณะที่คุณจะเปรียบเทียบ แล้วตัดสินใจว่าหลักฐานอะไรที่จะแยกแยะคำอธิบายสองแบบได้
สร้างโมเดล
- การแสดงออกของยีนสามารถถูกควบคุมได้ทั้งในระดับ transcription และขั้นตอนถัดไป transcription factor สามารถส่งผลต่อ transcription ผ่านการมีปฏิสัมพันธ์กับ DNA และโปรตีนอื่นๆ Epigenetic modifications สามารถส่งผลต่อการแสดงออกโดยไม่เปลี่ยนลำดับ DNA พื้นฐาน
- ปัจจัยการถอดรหัส: โปรตีนที่มีผลต่อการถอดรหัส; การดัดแปลงทางอณูชีววิทยา: การเปลี่ยนแปลงที่มีผลต่อการแสดงออกโดยไม่เปลี่ยนลำดับดีเอ็นเอ
What is justified by higher measured mRNA abundance?
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
Higher mRNA abundance shows more of that transcript under the measured conditions - nothing more. Protein level also depends on translation and degradation, and an expression change says nothing about the DNA sequence.
Match each technical term to its precise meaning.
Difficulty 2/5 · 140 coins + a small bonus on first completion today
Use the definitions to distinguish related quantities and processes.
เลือกหลักฐานมาทดสอบสมมติฐาน
- แยกแยะการเปลี่ยนแปลง mRNA ที่วัดได้จากการเปลี่ยนแปลงโปรตีนหรือการทำงาน Translation การสลายตัว และการดัดแปลงโปรตีนสามารถเข้ามาแทรกแซงได้ การควบคุมมีความเฉพาะเจาะจงต่อบริบทของเซลล์และสภาพแวดล้อม
- เปรียบเทียบข้อมูลการแสดงออกระหว่างกลุ่มทดลองและกลุ่มควบคุมหลังจากตรวจสอบการปรับมาตรฐานและซ้ำแล้ว ใช้หลักฐานจากการรบกวนที่จัดให้มาเพื่ออภิปรายโมเดลเชิงเหตุและผล แทนที่จะสมมติว่าทุกความสัมพันธ์คือกลไกโดยตรง
Which two habits make the investigation or model in this case more defensible?
Difficulty 2/5 · 140 coins + a small bonus on first completion today
Stating the conditions and assumptions lets others repeat the work exactly, and recording the supporting evidence lets them check the conclusion. Hiding disagreeing results removes the evidence that could challenge a wrong conclusion, and one measurement can never establish a wider claim.
ทำงานจากปริมาณที่ทราบค่า
- ระบุค่าที่ทราบและหน่วยของมัน เลือกความสัมพันธ์โดยพิจารณาว่าข้อสมมติฐานสอดคล้องกับเคสนี้ แล้วจัดรูปสมการก่อนแทนค่า
- ที่ทราบ: ความอุดมสมบูรณ์ของ transcript ที่ปรับมาตรฐานแล้วคือ 12 ในกลุ่มทดลองและ 3 ในกลุ่มควบคุม Fold change = 12/3 = 4 ความอุดมสมบูรณ์ที่ปรับมาตรฐานเท่ากันไม่จำเป็นต้องหมายความว่าจำนวนเซลล์จริงในตัวอย่างดิบทั้งสองเท่ากัน
ความอุดมสมบูรณ์ของ transcript คือ 15 ในกลุ่มทดลองและ 5 ในกลุ่มควบคุม หาค่า fold change ใช้ลำดับขั้นตอนเดียวกัน: ปริมาณที่ทราบ → โมเดล → ความสัมพันธ์ → แทนค่า → หน่วยและการตีความ
Transcript abundance is 15 in treatment and 5 in control. Find fold change.
Difficulty 2/5 · 140 coins + a small bonus on first completion today
The result is 3 . Known: abundance 15 in treatment, 5 in control. Use fold change = treatment / control. Fold change = 15/5 = 3. Normalized abundance can be compared without equal raw cell counts.
ตรวจสอบข้อสรุปและขอบเขต
- การเปลี่ยนแปลง epigenetic ไม่จำเป็นต้องเป็นการกลายพันธุ์ของลำดับ DNA เสมอไป mRNA มากขึ้นไม่ได้การันตีโปรตีนที่มีกิจกรรมมากขึ้นในอัตราส่วนเดียวกัน
- กลับไปที่การสังเกตเดิม อธิบายว่าผลลัพธ์นี้สนับสนุนสิ่งใด มีเงื่อนไขใดบ้าง และเป็นอย่างไรในการทดสอบคำอธิบายอื่นที่ขัดแย้งกัน
ทุกการเปลี่ยนแปลงในการแสดงออกของยีนคือกลายพันธุ์ ข้อความนี้ไม่ถูกต้อง: การเปลี่ยนแปลงการแสดงออกเป็นการควบคุม - โดยอ่านลำดับ DNA เดิมบ่อยขึ้นหรือน้อยลง กลายพันธุ์คือการเปลี่ยนแปลงในลำดับดีเอ็นเอเอง; ส่วนใหญ่การเปลี่ยนแปลงในการแสดงออกไม่มีการกลายพันธุ์เลย
Gene expression: ควบคุมผลิตภัณฑ์ ไม่ใช่แค่ยีน: แยกแยะการเปลี่ยนแปลง mRNA ที่วัดได้จากการเปลี่ยนแปลงโปรตีนหรือการทำงาน Translation การสลายตัว และการดัดแปลงโปรตีนสามารถเข้ามาแทรกแซงได้ การควบคุมมีความเฉพาะเจาะจงต่อบริบทของเซลล์และสภาพแวดล้อม
Every change in gene expression is a mutation.
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
Expression changes are regulatory - the same DNA is read more or less often. A mutation is a change in the DNA sequence itself; most changes in expression involve no mutation at all.
A protein that influences transcription: write the technical term.
Difficulty 1/5 · 100 coins + a small bonus on first completion today
transcription factor means A protein that influences transcription.